使用DNase I处理悬浮细胞团块
制备单细胞悬液对细胞分离是否成功至为关键。 使用含有细胞团块的样本进行细胞分离会导致细胞回收率降低,并且可能会影响正确的靶细胞标记。
当样本被反复冻融或者使用酶分解组织时,样本有时会呈现“团块状”。这是因为外界压力加速细胞死亡,从死细胞中释放出来的“粘性”DNA分子将邻近的细胞粘合在一起,因此产生了细胞团块。
在样本中加入脱氧核糖核酸内切酶 I(DNase I)可以减少DNA悬浮碎片和细胞团块。现今有许多使用DNase I以减少细胞团块的有效操作方法。我们推荐在细胞悬液中加入DNase I溶液 (产品编号 #07900)至终浓度为0.1 mg/mL(或者200 Kunitz units/mL),并在室温孵育15分钟之后进行下游应用。
下面的复苏冷冻样本的方法描述了使用DNase I制备单细胞悬液和减少细胞团块的操作步骤:
1. 在37℃水浴中快速旋冻存管。将解冻的细胞转入一个灭菌过的50mL圆锥管。
可选择:在圆锥管中加入0.25到0.5 mL初浓度为1 mg/mL DNase I溶液,然后再将解冻的细胞转入管中。
2. 用1 mL含10% FBS的培养基或缓冲液(例如PBS或者HBSS)冲洗冻存管,以收集管中残留的细胞,然后将培养基或缓冲液转移到新的试管中。
3. 缓慢逐滴加入10-15 mL的含10% FBS的培养基或缓冲液,同时缓慢摇动试管混匀。
4. 用含10% FBS的培养基或缓冲液补满50 mL试管。
5. 室温离心, 300 x g ;10分钟来收集细胞。
6. 小心地弃去尽可能多的上清液,尽量不要搅动细胞沉淀。轻轻拍打管壁来重新悬浮沉淀。
7. 如果细胞悬液看上去混浊,计算达到终浓度为0.1 mg/mL所需的DNase I,逐滴加入DNase I并同时缓慢摇动试管混匀。在室温下孵育15分钟。
8. 加入25 mL含2% FBS的培养基或缓冲液,轻轻倒置试管混匀然后离心(转速和时间与上面的步骤相同)。弃去尽可能多的上清液然后重新温和地悬浮沉淀。
9. 如果细胞悬液看上去仍然混浊,使用一个30-70 μm的细胞滤网过滤样本并移入新的试管中。使用含2% FBS的培养基或缓冲液洗涤试管,然后使用细胞滤网过滤, 重复三次。
10. 得到的细胞悬液可以进行细胞计数和之后的下游应用,例如细胞分选。
请注意:如果是对DNase比较敏感的下游应用(例如造血细胞集落检测),进行细胞计数前再使用恰当的检测缓冲液洗涤细胞一次。